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菹草是一种比较典型的秋季发芽、越冬生长的沉水植物。夏季，多数植株衰败死亡。菹草繁殖主要靠殖芽，殖芽发芽于10月初，平均水温低于23℃。随着水温下降，殖芽的发芽率提高，发芽适时间为10月底到11月初，平均水温20℃左右。发芽时间可延长到次年1月。生长速度以10-11月和3-4月较快。3月下旬至7月为开花结实期和殖芽形成期。殖芽成熟后落入湖底，7-9月，水温25-33℃，殖芽在湖底度过夏季休眠期，大多数植株逐渐衰败死亡。水温是影响菹草殖芽休眠和发芽的主要因素，当水温高于25-30℃时，殖芽处于休眠状态，低于20-25℃时，殖芽发芽。
